Uchiha klán: Az Uchiha klán különleges képességét a Sharingan szem teszi ki egészében. Az Uchihák kivételes ninja hírében állnak. A Sharingan szemmel bármit képes akár csak 1x-i látásra lemásolni, és később alkalmazni, így engeteg Jutsut tudhatnak magukénak. A Sharingan szem hátránya, hogy állandó használat mellett egy idő után használója látását vesztheti, amit persze ki tud küszöbölni, ha egy másik Uchiha látását (szemét) megszerzi magának. Ezután az adott Uchiha többé nem veszít a látásából.
(Ezt először Uchiha Madara tette)

Hyuuga klán: A Hyuuga klán küönleges képessége ugyancsak szemében keresendő. A Hyuuga klán különleges szeme a Byakugan, amivel majd 360 fokban képesek bármit (át)látni. A Hyuuga klánnak vannak fő- és mellékágai. A főág leszármazottjait a mellékág leszármazottjai védelmezik életük árán is akár, és védik a Hyuugák titkát. 

Aburame klán: Az Aburame klán egy bogárszelídítő klán. Ez annyit tesz, hogy a bogárszelídítő szövetséget köt a bogarakkal, a bogarak bármikor a klán tagjának védelmébe állnak, cserébe viszont beköltőznek a ninja testébe, vagyis a ninja egyben bogárhordozóvá válik, és onnan bármikor szólíthatja a bogarakat.

Akimichi klán: Az Akimichi klán leszármazottjai nem csak az étvágyukról híresek, hanem erejükről, vagyis arról a jutsuról, amit csak az Akimichi klán birtokol.

Yamanaka klán: A Yamanaka klán is egy különleges jutsu birtokáan áll. Képesek bárkinek a teste átküldeni a lelküket és ez által egy ideig uralni a ninja testét. A jutsu hátulütője az, hogy ha a megszállt test megsérül, ugyanolyan sérülést szenved a Yamanaka klán tagjának teste is, ráadásul a saját testére is vigyáznia kell, mert az védtelen marad, amíg a ninja a másik testét uralja.

Nara klán: A Nara klán leszármazottjai képesek irányítani az árnyékot, illetve bárkinek elkapni az árnyékát és megbénítani vele azt. De ezt a jutsut is csak addig tudják tartani, amíg chakrájuk tart.

Inuzuka klán: Az Inuzuka klán a kutyák (esetleg farkasok) erejét képes felerősítve használni. Emellett különböző chakraerősítő pirulát is szedhet, hogy felerősítse jutsuját. A klán tagja a jutsu használatakor 1000x élesebb szaglással bír, mint egy átlagos ember, vagy egy kutya.

Kaguya klán: A Kaguya klán különleges képessége a csonttal van összefüggésben. A klán tagja képes csontjait fájdalom nélkül „kivenni” a testéből, és fegyverként használni, de védekezésre is felhasználhatja csontozatát. Tulajdonképpen a különleges jutsuval testének csontjainak teljes urává válik a klán tagja.