A chakra az ember szellemi és fizikai erejének a keveréke. Egy olyan belső energia ami a chakra-ereken belül kering a szervezetben. Ezek az erek behálózzák az egész testet és körülveszik az összes belső szervet és sejtet, még a proteineket is. Ezt képesek vagyunk mentálisan irányítani.

5 Típus van:

-Szél

-Villám

-Tűz

-Víz

-Föld 

A chakra a chakra-keringésirendszerben áramlik. Ez rendelkezik 361 ponttal, ahol a ninja chakrát tud kiáramoltatni. Ezeket Tenketsu-nak nevezik. Ha a Tenketsut eltalálják, akkor megállítható a chakra áramlás. Ahol a legtöbb Tenketsu található, ott található egy kapu is. A chakra keringési rendszerben ugyanis van 8 kapu, ahol a legtöbb Tenketsu van. Ezek a chakra áramlást irányítják. 1. Nyitás 2. Energia 3. Élet 4. Sebesülés 5. Erő 6. Látvány 7. Őrület 8. Halál Ezeket ki lehet nyitni, de sok erő kell hozzá. Ha a nyolcadik kaput is kinyitják, akkor hatalmas erőhöz jutnak, de a használója belehal. A jutsuk A chakrával képesek jutsukat végrehajtani, ha a megfelelő kézpecsétek sorrendjét is megformázzák. A jutsuknak is vannak fajtái: -Taijutsu        (pusztakezes harc, melyhez nem kellenek kézpecsétek...) -Genjutsu       (illóziú technika) -Ninjutsu        (Ninja technika) -Doujutsu      (Kekkei Genkai, azaz vérvonal képességek, pl.:Byakugan, Sharingan stb.) -Kenjutsu      (tiltott, ezt Orocimaru akarta használni, hogy visszahozza egy Kenjutsu segítségével az unokáját, és a barátját Tsunadének, ha cserébe meggyógyítja a karját) -Hiden jutsu (tiltott) A jutsukat rangokra is lehet osztani: D szint: Genim C szint:  Chuunim, Genim B szint:  Jounim, Chuunim A szint:  Jounim, ANBU S szint: Kage, ANBU, Jounim A kézpecsétek:  A kézpecsétek a kínai horoszkóp ágaiból származnak. 12 kombináció van:                JUH               KÍGYÓ           KUTYA          MADÁR         PATKÁNY               KOS             TIGRIS           NYÚL             MAJOM           MALAC          SÁRKÁNY                   LÓ